Det er faktisk oksygen, ikke klor som er det aktive virkestoffet i klorin. Det inneholder natriumhypokloritt, NaClO, som veldig gjerne gir fra seg oksygenet og overgår til vanlig salt, NaCl. Oksygenet i sin tur er da et ensomt reaktivt atom som binder seg til nesten hva som helst, og dermed ødelegger mange organiske molekyler som gir lukt, flekker eller er kritiske deler av bakterier og virus.
Det finnes reaksjoner der kloret inngår eller blir frigitt også, derfor skal det aldri blandes med annet.