Rykk-og-napp-nett som du opplever skrev jeg om før her.
Du har ikke tatt vekk auto speed på porten(på cisco). Force porten til 1000gbit fullfuplex, og alle problemen blir borte.
(det er cisco og HET mediakonverter, som ikke er helt happy med auto på port speed)

Fra første posten min :
Speed and duplex : 1000baseT full-duplex (hvis den står til auto får du ca 0,1% data error, er fiber box'ens feil)