Har selv en slik kjørende, med to virtuelle maskiner som kjører i hyper-v. En pfSense router-maskin og en Debian-maskin som tar seg av diverse mindre serverrelaterte oppgaver som ganske enkelt funker best på Linux siden det er mer programvare tilgjengelig.
Hyper-V i Server 2012 er jo ikke så alt for gammel og ser ut til å ha ålreit støtte for mange systemer, inkludert syntetiske nettverkskort som fungerer i pfSense noe som gir betraktelig bedre ytelse.

Nå skal jeg på ingen måte skryte på meg at jeg er noen ekspert på dette området, bare så det er sagt.
Virtuelle maskiner i hyperv kan gis flere disker, enten i form av vituelle disker lagret i en fil eller hele fysiske harddisker, er derfor nær sagt ubegrenset hvor mye lagringsplass de kan ha. -Virtuelle disker kan dog ikke være større enn 2TB.
SErver2012 sin innebygde backupfunksjon kan jevnlig ta fulstendig backup av valgte vituelle maskiner (Eller alle for den saks skyld) og lagre de hvor som helst. Disse kan enkelt gjenopprettes dersom det er nødvendig.
Er også mulig å ta en fulstendig snapshot av hele den fysiske maskina.

Valg av OS, koker vel ned til hva du skal bruke den til.
Dersom du foretrekker Windows bruker du sekvsagt det, så fremt det finnes programvare til oppgavene du vil bruke den til.
Slik sett har Linux en stor fordel da det finnes veeeldig mye programvare tilgjengelig. Debian er et godt valg for nybegynnere i Linux-verden siden mange programmer er å få tak i som ferdige pakker som lastes ned og installeres automagisk i fra terminalen, f.eks Apache webserveren: sudo apt-get install apache -Enkelt